Авторские права всегда принадлежат авторам. И до публикации и после. Публиковать полнотекстовые статьи всегда автор имеет право на странице своего вуза, публичной странице. И это соблюдается особенно в цивилизованных странах, где считается само собой разумеющимся, что преподаватель (он же ученый) на своей странице размещает полнотекстовую статью.

А вот отправлять одну и туже статью в несколько изданий нельзя. Так как сайт вуза не является изданием и не регистрируется как СМИ, то никаких нарушений прав издательства нет. Авторы само собой указывают в описании статьи журнал, где напечатана статья.

Это уже зависит от конкретного журнала, точнее от содержания лицензионного договора между издателем журнала и авторами статьи. Выше в цитате был приведен лишь пример, возможны и другие варианты.

Хоть и поздновато уже, но не удержусь от "особого мнения" - категорически не рекомендую джумлу, вордпресс и вообще любые движки требующие динамической генерации контента. Во-первых - небезопасно, во-вторых - бессмысленно.
Это ведь _информационный_ сайт, а не домашняя страничка тинейджера с обязательными комментариями к фотографиям с его первых опытов с алкоголем.

Гораздо удобнее и логичнее использовать системы генерации статических страниц вроде jekyll.
В этом случае сайт можно вообще бесплатно разместить на github.com в добавок получив версионность для статей: http://www.juev.ru/2010/11/13/jekyll-hyde/ - вот хорошая ознакомительная статья на русском.

Добавлено через 1 минуту
Вот уж не думал что такое возможно, но в данном случае согласен на 100% :)