Т.е. мне нужно получить характеристику у научного, ехать в Новосиб, забирать там моё дело и тоже взять характеристику или другую бумагу?
Я не поняла, а зачем вам ещё какая-то другая характеристика, кроме той, которую даст научный?
Вам надо забрать личное дело и взять характеристику у научного, а также получить направление от отдела аспирантуры вашего ВУЗа в отдел аспирантуры того института, куда вы хотите перевестись.
В этой бумаге должна быть обоснована причина вашего перевода, поэтому подумайте на этим (причина типа науч. рук. - дурак

- не катит, чаще всего в виде причины указывают отсутствие нужной специальности в родном вузе).