Если статьи в соавторстве, ничего страшного. Вы имеете одинаковые права на результат. Тем более, что НР вас не "кидает", а предлагает выйти на защиту. В такой ситуации это редкость.
Так что выходите. Если кто-то и найдёт сходство, НР скажет "мы делали работу вместе и вместе публиковали".
Конечно, диссертация - персональная работа по определению. Но он же у вас не всё скопипастил
А иметь общие результаты с кем-то не возбраняется.
Но, конечно, НР должен был с вами посоветоваться прежде чем брать ваш результат...
Добавлено через 1 минуту
Кстати, тут уже обсуждали, что первенство публикации не является гарантом оригинальности. Так что факт выхода работы вашего НР первой не является автоматическим признаком вашего плагиата
Для определения плагиата потребуется разбирательство, которое будет только если это кому-то станет очень нужно. В вашей ситуации это врядли.