1. Официальная статистика(с какой бы погрешностью она не была) может послужить отправной точкой, отдельные формы для сбора информации об инновационной деятельности(4-инновация,2-наука и т.д) исключают малые предприятия из выборки, для малых специальная форма "2-МП инновация".По идеи данные из этих форм,публикуются в каком-нибудь сборнике(можно посмотреть перечень на сайте Росстата)
2.при многих Вузах созданы центры инноваций и некоторые проводили опросы среди партнеров, работающих студентов о применении инноваций, эффективности и т.д. в организациях(например ВГУ)
3.Посмотрите сайты бизнес-инкубаторов, администраций области, в которых активно позиционируется внедрение инноваций, центров развития малого бизнеса при Сбербанке, возможно там будет какая-либо информация о внедренных на малых предприятиях инновациях, в качестве отчетов о проделанной работе
Добавлено через 3 минуты
http://www.nair-it.ru/analytics/-посмотрите еще здесь, может напишите какое-нибудь письмо от кафедры, с просьбой предоставления инфоормации для написания диссертации