Добавлю свои пять копеек.
По одному из проектов (почти законченному, вкл. наличие десятка статей) мне говорят - пиши докторскую. Вариант хороший, но есть более интересные в данный момент (и что немаловажно, финансово обеспеченные) и важные для практики и науки задачи. Вот и нужно выбирать: потратить полгода на оформление кирпича (просто собрать все статьи в кучу не получится, немного разные обозначения в моделях) или заниматься другими проектами.
Если оставят двухуровневую систему, обязательно когда-нибудь выберу первый вариант. Но зачем вся эта мышиная возня, включая бюрократическую составляющую, я не пойму? Был бы доктором, наверное понял.