Shuhrat задал конкретный вопрос: каков
перечень программ, которыми аспирант должен (или может)
пользоваться.
Так что "многомудрые" коллеги - теперешние и будущие ученые и преподаватели, напрягите свои педагогические способности и без лишней полемики, драматизации и личностей дайте
дельный совет человеку!
Если кто знает проги полезные аспиранту, то просто перечислите их, охарактеризуйте достоинства/недостатки, укажите ссылки и т.п.
gav, а я сказал быть толерантным к невежеству? 
Надо толерантным и доступным путем просвещения, обучения и воспитания искоренять явную глупость, субъективность, несправедливость, воинствующее невежество! 