Если кусков немного, то можно проставить нужные страницы и сохранить каждый файл в pdf. Потом сшить вместе в том же Adobe Pro или какой-нибудь бесплатной утилите. Например, понравилась эта:
http://www.pdfsam.org/ Или распечатать на виртуальном pdf-принтере.