Зависит от журнала/издателя.
К примеру, издательство mdpi, чьи Open Access журналы стремительно набирают популярность, вообще не заморачивается - основной способ подачи - по их шаблону в MS Word (впрочем, есть мануал для любителей LaTeX), который идет в печать практически "как есть", разве что добавляются необходимые колонтитулы и вносятся минимальные косметические изменения