У них сейчас немного изменились требования, но суть таже.
1. Заполняете ведомость :
http://db.inforeg.ru/deposit/2-vedsd.doc как физ.лицо.
2. При регистрации от физического лица - документ, подтверждающий редакционно-издательскую обработку ЭИ, или рекомендация юридического лица, принимающего на себя ответственность за легитимность публикации -
вот этого раньше не требовалось, но "состряпать" можно в свободной форме 
3. Записываете 5 дисков (раньше 4 было) Вашего электронного учебника (я через цветной принтер прогонял название и автора учебника) и помещаете в пластиковую коробку (я отправлял в бумажных)
4. Запрос о направлении свидетельства о регистрации по такому-то почтовому адреса
5. Отправляете ценной посылкой с описью вложения.
6. И через 1-1,5 месяца они регистрируют и высылают Регистрационное свидетельство №_____ от ___.
Настоящее свидетельство выдано на представленное в Депозитарий электронное издание на 1 CD-R "Название" ((с) ФИО)
Производитель:
Издание зарегистрировано ____ и ему присвоен номер гос. регистрации ____.
Этот номер потом можно использовать в библиографическом описании при ссылке на учебник (что-то вроде как рег. № у статей).
Один диск у них остается, остальные рассылают по библиотекам для пользования.