[Vasily]

GnuPlot (freeware) - вещь хорошая, но достаточно сложная в освоении (у неё свой собственный язык). Раньше я им не пользовался, но когда захотел поверхности отклика нарисовать из linux, справился часа за два. Правда, вручную (связка kscreenshot-kpaint-gimp-OpenOffice Writer) их перекрашивал. Конечно, можно было выбросить сразу дамп в файл-картинку, но просмотреть и сделать снимок было проще.
Думаю, такие вещи можно освоить и в самом gnuplot, но он что-то сильно запахом си отдаёт. А я - паскалист. Мне легче к Lazarus компонент прикрутить, чем это осваивать.
Что касается графиков функций (в т.ч. и регрессий), их можно строить в каком-нибудь Maple или Mathematica. Что же до точек, excel - ужас, я согласен. Чуть больше можно сделать в OpenOffice Calc (freeware). Кто вдруг привык к Matlabу - он подойдёт. Или Octave (freeware). Текущий StatGraph неплохо экспортирует графики.